多肽链纤维生成的决定因素的确定：使用晶格模型
摘要：使用晶格模型，我们探索了决定多肽链聚集趋势的因素，通过对序列和构象空间进行全面的抽样。纤维样结构的形态以及形成的时间尺度（$ au_{fib} $）取决于疏水和库仑相互作用之间微妙的平衡。纤维倾向结构在单体构象光谱中的分布程度是$ au_{fib} $的主要决定因素。我们利用这一观察结果通过对序列空间进行全面搜索来确定具有聚集倾向的共识序列。我们的结果为基因组范围内搜索易聚集碎片提供了基础。
作者：Mai Suan Li, Nguyen Truong Co, Govardhan Reddy, C-K Hu, and D. Thirumalai
论文ID：1003.4624
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2010-03-25