利用L系统完成人类线粒体基因组构建

摘要:用各种实验程序以及采用多种工作假设,科学家们最近在The Craig J. Venter Institute报道了构建非常长的DNA分子。找到生成这种长序列的数学规律将彻底改变我们对生物学各个高级领域的思考,例如染色体中长DNA链的进化、长段非编码区存在的原因,以及为染色体工程制备长DNA链的自动化方法。然而,这个数学原理必须有容纳在基因组的那些突变和/或DNA聚合酶在数百万年间引入错误的局部区域中编辑/校正DNA序列的余地。在本文中,我们报告了应用L系统(一种数学原理)解决所有上述问题的基本原理和应用。最后,我们展示了使用PC计算能力使用这种数学原理生成的整个人类线粒体基因组。现在我们可以声称,即使只用PC计算能力,我们也能制作任何一段DNA,包括936个碱基对的嗅觉受体、带有或不带有内含子的线粒体DNA,甚至整个人类基因组的30亿个碱基对的DNA序列。

作者:Sk. Sarif Hassana, Pabitra Pal Choudhury, Amita Pal, R. L. Brahmachary and Arunava Goswami

论文ID:1002.3292

分类:Other Quantitative Biology

分类简称:q-bio.OT

提交时间:2010-05-05

PDF 下载: 英文版 中文版pdf翻译中