寡核苷酸微阵列快速背景减除的线性模型
摘要：基于线性代数的背景估计算法在基因芯片数据分析中是一个重要的预处理步骤。该模型考虑了邻近特征之间相关的强度以及序列依赖的非特异性杂交特性，通过最小化拟合参数的二次代价函数来进行背景估计。该算法经过360个公开可用的基因芯片数据的测试，快速而准确。不同实验的拟合值之间以及自由能参数和其在水溶液中的对应物之间存在强相关性，表明该模型能够捕捉到底层物理化学的显著部分。
作者：K. Myriam Kroll, Gerard T. Barkema, Enrico Carlon
论文ID：0912.1277
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2009-12-08