17,134个模型蛋白质和半胱氨酸滑结的机械强度
摘要：蛋白质对恒定速度拉伸的抵抗性能的新理论调查是基于结构模型对一组17,134个蛋白质进行的。所选蛋白质的结构探测没有缺口，且最多由250个氨基酸组成。我们之前的研究涉及到最多150个氨基酸的7510个蛋白质。蛋白质基于其抵抗力的强度进行排名。大多数预测出的强抗力蛋白质尚未进行实验研究。鉴定了可能产生大力量的体系和折叠形式。发现了新类型的强力夹具，其中包括二硫键和特别是半胱氨酸滑套结。通过将理论数据与相应的实验值进行比较，并结合将理论数据外推到实验拉伸速度的方法，估计了模型的有效能量参数。这些研究为未来单分子操作的实验提供指导，并应选择适用于应用的蛋白质。通过分子动力学模拟，鉴定了一种新的蛋白质类别，其中包含半胱氨酸滑套结，该类别预期将产生最强的力夹具。
作者：Mateusz Sikora, Joanna I. Su{l}kowska, Marek Cieplak
论文ID：0911.0453
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2009-11-04