人类基因表达在EBV转化细胞系中的年龄、性别和遗传结构
摘要：年龄、性别和遗传变异对基因表达的影响 使用EBV转化细胞株的个体表达谱是基因组研究的新资源。 通过调查这些表达谱的公共数据集，我们对年龄、性别和遗传变异对基因表达的影响进行了表征。 我们确定细胞株的表达空间保持了遗传信息和非生殖细胞系特异的信息，在个体特异性和组织间交叉方式上。 供体年龄与衍生细胞系中949个基因的表达相关联。 与年龄相关的基因中包括免疫相关基因的过度表达，特别是MHC I类基因，这种现象在各种组织和生物中复制。 这些细胞系中与性别相关的基因包括可能的候选基因，如逃逸X染色体失活的基因，睾丸特异性表达基因和雌雄激素特异性基因，还有以前未知与性别相关的基因家族，如共同的microRNA靶基因。 最后，我们报告了494个转录本表达水平与顺式遗传变异相关联，与先前的报告重叠并验证。 将年龄纳入关联分析有助于进一步发现顺式调控遗传变异。 我们的发现促进了对转化细胞系的表达谱进行的研究，以深入了解细胞系统。
作者：Manuel A. Rivas, Mark J. Daly, Itsik Pe'er
论文ID：0911.0215
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2009-11-03