病毒外壳自组装的建模
摘要：使用计算机模拟研究了一个由Wales [1]首次提出的模型，用于研究简单二十面体病毒衣壳结构的可逆单分散自组装。组装的成功和效率可以根据组装系统的势能景观结构与热力学和几何因素的关系加以定性分析。虽然该模型粗粒化程度较高，但它也展示了一些实验观察到的特征，如S型组装动力学、衣壳形成中的磁滞现象和众多的动力学陷阱。我们还研究了巨分子拥挤对组装动力学的影响。拥挤剂通常会减少在非拥挤组装的最佳条件下的衣壳产量，但在远离最佳条件的参数范围内，可能会增加产量。最后，我们将模型推广到更大的三角化数T = 3，并观察到比原始T = 1模型更复杂的组装动力学。
作者：Iain G. Johnston, Ard A. Louis, Jonathan P. K. Doye
论文ID：0910.1916
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2010-02-24