通过具有双峰分布的蛋白质相互作用网络放大和检测单分子构象波动
摘要：蛋白质经历具有多个时间尺度的构象动力学，导致酶活性波动。最近的单分子酶学研究直接观察到了这种“古老”的动态不稳定现象。然而，单分子技术有其局限性。为了能够观察到这种分子效应与实际生化功能的耦合，我们提出将酶活性的波动与小蛋白质相互作用网络中的噪声传播耦合在一起，例如零阶超敏磷酸化-脱磷酸化循环。我们展示了酶波动确实可以被放大数倍，成为细胞生物学中广泛关注的底物磷酸化水平的波动。酶构象波动足够慢且低于催化反应周转速率的，会产生磷酸化底物的双峰浓度分布。作为回报，网络放大的单个酶波动可以用作测量单个酶构象波动率的新型生化“报告物”。
作者：Zhanghan Wu, Vlad Elgart, Hong Qian, Jianhua Xing
论文ID：0909.0189
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2009-11-10