一种高效的精确随机模拟化学反应网络的新类算法
摘要：基于分解的、部分反应倾向性的方法的精确随机模拟算法（SSA）的替代性的表达式引入了化学主方程的轨迹采样的方法。我们的表达式是基于分解出来的、部分反应倾向性的。这个新的精确的SSA称为部分倾向性直接方法(PDM)，它非常高效，并且其计算成本与化学物种的数量最多呈线性关系，而不受反应网络的耦合程度的影响。此外，我们提出了一个排序变体，SPDM，对于多尺度反应网络尤其高效。
作者：Rajesh Ramaswamy, N''elido Gonz''alez-Segredo and Ivo F. Sbalzarini
论文ID：0906.1992
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2015-05-13