蛋白质折叠中的过渡态
摘要：两态蛋白质的折叠动力学是模拟和实验的一个当前重点。许多这些蛋白质是“两态折叠体”，即蛋白质从变性态直接折叠到原生态，而不产生亚稳态中间状态。一个核心问题是如何表征两态蛋白质的不稳定部分折叠构象，特别是变性态和原生态之间限速的过渡态构象。这些部分折叠构象的存在时间很短，无法直接在实验中观察到。然而，来自对折叠动力学进行详细突变分析的实验数据提供了间接访问过渡态的方法。对于这些数据的解释，尤其是过渡态构象的重建，需要进行模拟和建模。传统的突变数据解释的目标是重建过渡态中个别残基的结构形成程度，而新的解释目标是重建协同亚结构（如α螺旋和β发夹）的结构形成程度。通过将突变引起的自由能变化分解为二级和三级结构组分，新的解释解决了传统解释中的一些不一致之处。
作者：Thomas R. Weikl
论文ID：0904.3233
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2020-01-08