振动熵与蛋白质的结构组织
摘要：分析非同源蛋白质结构的振动光谱，通过一种新型工具，被我们称为分层网络模型（HNM）。我们的粗粒化方案考虑了蛋白质结构所展现的力常数的固有异质性，还考虑了侧链的自由度。我们的分析显示，单位残基的振动熵与二级结构的含量相关。此外，我们评估了我们方案的新特点对振动熵的个体贡献，与最先进的网络模型预测进行了比较。这种分析凸显了恰当考虑由组成和稳定蛋白质支架的不同原子键具有的固有层次结构的重要性。最后，我们讨论了我们的发现可能对蛋白质聚集现象的影响。
作者：Lorenzo Bongini, Francesco Piazza, Lapo Casetti and Paolo De Los Rios
论文ID：0902.1941
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2009-02-12