可以用多项式时间从密集的三元组集中构建出k级系统进化网络
摘要：给定一个稠密的三元组集合$mathcal{T}$，会有两个有趣的问题产生：是否存在与$mathcal{T}$一致的系统发生网络？若存在，我们能否找到一个有效的算法来构建一个？对于$k=0$或1或2级网络的情况，这些问题已经通过有效的多项式算法得到了回答。对于更高级别$k$，最近已经通过一个$O(|mathcal{T}|^{k+1})$时间复杂度的算法获得了部分答案。在本文中，我们给出了一般情况的完整答案。主要思想是利用$k$级网络中SN集合的一个特殊属性。作为一个结果，我们还可以在多项式时间内找到具有最小数量交织点的$k$级网络。
作者：Thu-Hien To and Michel Habib
论文ID：0901.1657
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2009-01-13