蛋白质折叠中的流体动力学相互作用
摘要:融入水动力学相互作用(HI)到粗粒化和基于结构的蛋白质模型中,采用Rotne-Prager水动力学张量。利用该模型研究了几个小蛋白质,并证明HI有助于蛋白质的折叠。我们还研究了HIV-1蛋白酶,表明HI使得翻盖关闭动力学更快。尽管HI对于围绕原生态状态的结构波动的同时间特性没有影响,但发现它们会影响原生态状态附近的时间关联函数。
作者:Marek Cieplak and Szymon Niewieczerza{l}
论文ID:0901.0086
分类:Biomolecules
分类简称:q-bio.BM
提交时间:2009-11-13