单分子水平的定量转录因子结合动力学
摘要：研究用全内反射荧光显微镜观察细菌噬菌体lambda抑制子CI与其目标DNA之间的结合相互作用。观察到与CI融合的红色荧光蛋白与单个标记分子DNA靶点的结合和解离之间出现了大的、逐步变化的强度变化。随机结合和解离过程符合泊松统计学。我们测量了数千个个体事件的黑暗和明亮间隔。间隔的指数分布允许直接确定结合和解离速率常数ka和kd。我们详细地解析了ka和kd如何随着3个控制参数的变化而变化，即DNA长度L、CI二聚体浓度和结合亲和力。我们的结果表明，尽管可以观察到与非运算子DNA序列的相互作用，但CI与运算子位点的结合不依赖于非运算子DNA的长度。
作者：Yufang Wang, Ling Guo, Ido Golding, Edward C. Cox, N. P. Ong
论文ID：0811.3950
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2015-05-13