蛋白质中超二级结构的分类：使用自动蛋白质结构分析方法
摘要：自动蛋白质结构分析（APSA）方法用于超二级结构的分类。分类的基础是将三维残基构象编码为16个字母的代码（3D-1D投影）。研究表明，蛋白质的字母代码可以无歧义地重构其整体形状（1D-3D转换）。因此，基于字母代码，可以开发区分超二级结构的分类规则，这些规则通过其转折和周围α螺旋或β链的定向来区分。转折和周围结构的定向被收集在一个八分制系统中，用于指定α,α-、α,β-、β,α-和β,β-类的196个超二级结构组。对391个蛋白质链进行了分析，共得到2499个超二级结构。通过八分制分类系统，可以识别常见的超二级结构，并基于其字母和分类代码进行解释。
作者：Sushilee Ranganathan, Dmitry Izotov, Elfi Kraka, and Dieter Cremer
论文ID：0811.3464
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2008-11-24