DNA纳米机械：蛋白质如何变形双螺旋
摘要：从变形的双螺旋DNA与蛋白质复合物中，通过已知的弹性特性和静态形态，推断身体的外力和扭矩，这是机械工程中的一个标准练习。我们利用这种分析方法提取结合的DNA的每个碱基对上的局部平均力和扭矩，从高分辨率的复合物结构中。我们的方法依赖于已知的弹性势能和良好建立的刚性碱基对模型的坐标选择。结果对于参数和构象不确定性是稳健的。结果揭示了蛋白质和DNA之间的复杂纳米力学相互作用模式。碱基对的力和扭矩与观察到的DNA构象非常复杂地和非局部地相关，为DNA-蛋白质结合提供了一个与结构分析互补的新视角。
作者：Nils B. Becker and Ralf Everaers
论文ID：0809.3938
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2009-11-13