磷脂双分子层中脂质原子和分子的亚扩散和侧向扩散系数

摘要:分子动力学模拟的研究:DMPC脂质双层中甘油脂酰基磷脂酰胆碱(DMPC)脂质分子中所选的脂质原子和脂质分子的动力学行为。通过对0.1μs的分子动力学轨迹进行分析,我们发现脂质原子和分子的平均平方位移的时间演化,[delta{r}(t)]^2,呈现出三个相互独立的动力学区域:(i) 飞行,对于t < 10 fs,[delta{r}(t)]^2 ~ t^2 ; (ii) 亚扩散,对于10 ps < t < 10 ns ,[delta{r}(t)]^2 ~ t^{eta} ,其中 eta<1 ; (iii) Fick扩散,对于 t > 30 ns ,[delta{r}(t)]^2 ~ t 。我们提出了一种记忆函数方法来计算从飞行到Fick扩散区域的整个时间范围内的[delta{r}(t)]^2。结果与分子动力学模拟的结果非常一致。我们还研究了脂质亚扩散动力学对中子散射实验中的自相关散射函数和不相关动力学结构因子的影响。

作者:Elijah Flenner, Jhuma Das, Maikel C. Rheinstadter, Ioan Kosztin

论文ID:0809.2986

分类:Biological Physics

分类简称:physics.bio-ph

提交时间:2009-11-13

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