相互关系对分子识别的影响

摘要:两个刚性生物分子界面上疏水和极性残基分布的不均匀性和相关性对它们的识别能力的影响在理想化的粗粒化格子模型中进行了研究。采用了一种一般的两阶段方法,首先设计了一组探针分子,然后将探针分子的识别能力与目标分子和不同竞争分子的自由能关联起来。使用数值蒙特卡罗技术和均场方法研究了相关效应的影响。相关性导致了两个生物分子的相互设计以及它们在存在其他分子时的识别能力的最佳特征长度不同。

作者:Hans Behringer, Friederike Schmid

论文ID:0809.1804

分类:Biological Physics

分类简称:physics.bio-ph

提交时间:2009-11-13

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