脂质双层中基于一般粗粒化模型的膜蛋白相互作用
摘要：膜蛋白相互作用和膜介导的蛋白质相互作用是通过蒙特卡洛模拟来研究的，使用了一个具有圆柱形疏水包含物的脂质双层的通用粗粒化模型。疏水力的强度和蛋白质的疏水厚度被系统地变化。结果与两个流行的分析理论进行比较：Landau-de Gennes理论和弹性理论。弹性理论提供了对纯膜的波动谱的出色描述，并成功地重现了单个蛋白质周围膜的变形轮廓。然而，它对蛋白质之间的平均力势的预测与模拟数据在大距离上不一致。模拟结果表明，脂质介导的相互作用受到五个竞争因素的控制：直接相互作用、脂质诱导的耗尽相互作用、脂质桥接、脂质包装和平滑的长程贡献。对导致“疏水失配”相互作用的机制进行了关键分析。
作者：Beate West, Frank L.H. Brown, Friederike Schmid
论文ID：0809.1797
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2009-11-13