利用数字PCR在纳米流体装置上计算拷贝数变异的最大分辨率。

摘要:DNA样本中的拷贝数变异(CNVs)在疾病关联研究中非常重要。数字阵列是一种纳米流体生物芯片,利用集成通道和阀门将样品和试剂混合物分割成765个纳升级反应室。最近,已经展示了如何在数字阵列中对DNA样本进行CNV的统计分析。具体而言,已经展示了如何准确估计DNA样本中分子的真实浓度,然后确定不同序列的比率以及这些估计值的统计置信区间。在本文中,我们计算了使用数字阵列可以区分的最大拷贝数,从而确定其解决CNV的能力。然后,我们展示了数学分析方法在解决决定X染色体拷贝数的重要现实问题中的实用性。

作者:Simant Dube, Alain Mir, Robert C. Jones, Ramesh Ramakrishnan, Gang Sun

论文ID:0809.1460

分类:Genomics

分类简称:q-bio.GN

提交时间:2008-10-27

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