核酸热再结构和杂交的机制:克莱默过程与Watson-Crick碱基配对的普适性
摘要:DNA和RNA分子的重组与杂交反应是生物体内重要的生物学过程。本研究通过理论模拟和实验验证,揭示了在高温条件下(低浓度的单链DNA或RNA分子,在高浓度的盐溶液中)DNA和RNA分子重组的机制。研究发现,重组反应主要经过一个关键的核化事件,该事件导致了首次互补碱基配对的形成,然后通过双链的快速生长来完成整个反应。实验结果显示,在核酸分子的平均聚合度范围内(100≤⟨N⟩≤50000),反应速率与聚合度呈幂函数关系。从理论上预测的指数为0.52±0.01与实验结果吻合。这一关系的产生是由于热力学排除体积效应的影响。本研究还预测了单链核酸分子处于良溶剂条件下,并且缩放律是由相关的平衡单体接触概率决定的。
作者:Jean-Louis Sikorav, Henri Orland, Alan Braslau
论文ID:0808.1233
分类:Biomolecules
分类简称:q-bio.BM
提交时间:2009-01-05