甲骨文核受体的注释揭示了控制蜕皮激素级联反应的网络进化过度加速
摘要：Tribolium基因组包含21个核受体，代表了所有已知的六个亚家族。与其他物种相比，这是甲虫目中第一个完整的核受体组合，揭示了完全变态昆虫中核受体数量和身份的强大保守性。观察到两个新发现：非典型的NR0基因knirps仅存在于苍蝇属中，而NR2E6基因仅在Tribolium和Apis中发现。通过对进化速率的定量分析，我们发现核受体可分为两组。在13种蛋白质的一组中，速率遵循了Mecopterida全基因组加速的趋势。在另一组五种核受体中，所有这些受体一起作用在ecdysone级联顶部上，我们观察到在Mecopterida早期分化过程中进化速率过速的现象。因此，我们将分析扩展到了十二个经典的ecdysone转录调节因子，并发现其中六个（ECR，USP，HR3，E75，HR4和Kr-h1）在Mecopterida谱系的基部经历了过快的进化。相比之下，E74，E93，BR，HR39，FTZ-F1和E78则不显示这种分化。我们认为在控制ecdysone级联的调节因子网络中发生了共同进化。Tribolium作为一个强大的模型的出现，应该能够更好地理解这种进化。
作者：Franc{c}ois Bonneton (IGFL), Arnaud Chaumot (UR BELY), Vincent Laudet (IGFL)
论文ID：0806.3823
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2008-12-18