系统生物学中的粗略性、鲁棒性与进化能力

摘要:生物化学网络的许多功能通常是健壮的——在外部条件和内部反应参数变化下具有非常稳定的性能。最近关于健壮性和可进化性的许多研究都集中在中性空间的结构上,其中系统的行为对突变保持不变。最近我们发现,多参数模型的集体行为往往是“松弛”的:在除了少数“僵硬”参数组合之外,对变化不敏感,存在巨大的松散中性子空间。健壮性通常被认为是一种 emergent evolved 属性,但生物化学网络固有的松弛特性提供了一种非自适应的解释。相反,为研究健壮系统中的可进化性所开发的想法可以有益地扩展为表征松弛系统。

作者:Bryan C. Daniels, Yan-Jiun Chen, James P. Sethna, Ryan N. Gutenkunst, and Christopher R. Myers

论文ID:0805.2628

分类:Quantitative Methods

分类简称:q-bio.QM

提交时间:2011-03-15

PDF 下载: 英文版 中文版pdf翻译中