用DIYABC推断人口历史：一种用户友好的近似贝叶斯计算方法
摘要：基于近似贝叶斯计算（ABC）的推断是从人口样本获得的遗传数据所能传达的其进化历史信息。推断方法可以提取这些信息（至少部分），但它们需要复杂的统计技术，这些技术目前仅针对生物学家社区提供了针对简单和标准情况的计算机程序。我们在这里提出了一个基于ABC的计算机程序（DIYABC），用户可以自定义场景以适应涉及任何数量的人口和样本的复杂情况。这些场景涉及人口分化、混合和逐步人口规模变化的任意组合。DIYABC可用于比较竞争场景，为一个或多个场景估计参数，并对给定的场景和已知参数值计算偏差和精度度量（当前版本适用于非连锁微卫星数据）。本文介绍了程序中使用的关键方法并提供其主要功能。对一个模拟数据集和一个具有复杂进化场景的真实数据集的分析，说明了DIYABC的主要可能性。
作者：Jean-Marie Cornuet, Filipe Santos, Mark A. Beaumont, Christian P. Robert, Jean-Michel Marin, David J. Balding, Thomas Guillemaud and Arnaud Estoup
论文ID：0804.4372
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2008-10-08