分子伴侣体内疏水效应的调节潜力
摘要：分子的折叠反应在细胞内通常需要靠名为分子伴侣的多聚体结构参与。尽管众所周知分子伴侣能够通过将底物隐藏在其内部的机制来促进底物的折叠，但是在这个空间中具体如何促进折叠仍然不清楚。本研究探讨了分子伴侣在折叠反应中通过改变溶剂环境有利于分子重组的可能性。我们首先讨论了电荷对水环境中溶剂介导的疏水力的影响。基于这些初步的物理参数，我们建立了一个简单的现象学理论来描述液体水中密度和氢键阶序波动的热力学。在这个模型的框架下，我们通过计算ATP驱动的原核分子伴侣GroEL催化循环中对应不同构象状态的空腔的溶剂自由能，研究了在分子伴侣样腔体中限制效应对水的构象自由能的影响。我们的发现表明，分子伴侣的一个功能可能是捕获未折叠的蛋白质，并将其置于一个增强疏水效应的微环境中。
作者：Jeremy L. England and Vijay S. Pande
论文ID：0802.0522
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2009-11-13