细胞核内目标的搜索动力学
摘要：转录因子（TF）或酶在细胞核中寻找目标所需的平均时间对于初始化转录、基因激活或DNA修复的开始至关重要。当TF或酶限制在细胞核内从沿DNA的一维运动转换为在拥挤核内的自由布朗运动时，我们获得了关于平均搜索时间的新估计。我们给出了粒子绑定在DNA上的平均时间$au_{DNA}$和自由扩散的平均时间$au_{free}$的解析表达式。与以前的结果相反，但与实验数据一致，我们发现Lac-I TF的因子$au_{DNA}$约为$3.7au_{free}$。得到的结合到目标位点所需时间的公式与观察数据一致。我们还得出结论，更高的DNA密度会导致更有效的搜索过程。
作者：G. Malherbe, D. Holcman
论文ID：0712.3467
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2007-12-21