细菌中"+1"帧移的机制模型
摘要:应用信号处理方法和控制系统设计概念来模拟蛋白质合成过程中的维护和调制读码框。该模型展示了如何调节翻译速度以实现编程的+1移码,并可能对翻译效率的调节产生影响。在真细菌的翻译延伸过程中,通过核糖体与mRNA序列的相互作用计算了一系列自由能估计值。在这些自由能信号中检测到了近似恒定相位的正弦模式。信号相位被确定为用于定位编码在细菌基因中的编程+1移码的有用参数。根据信号参数的信息内容和细菌细胞中tRNA的相对丰度,开发了一个位移模型来捕捉移码的机制。结果使用已经验证的真细菌中的移码基因呈现。
作者:Lalit Ponnala, Donald Bitzer, Anne Stomp, Mladen Vouk
论文ID:0712.2068
分类:Genomics
分类简称:q-bio.GN
提交时间:2007-12-14