二面角高斯分布驱动蛋白质折叠

摘要:简单的角随机行走模型构建了多肽结构,包括折叠的蛋白质的二面角特性。根据狭窄的高斯概率分布,使用不同比例的二级结构基元的二面角随机选择来构建长度为125到400个氨基酸的结构。为了测量蛋白质的分形维度,分析了三种不同情况。第一种情况仅包含α-螺旋结构,第二种情况是β-链结构,第三种是α-螺旋和β-片层的混合。具有α-螺旋基元的蛋白质的行为比其他情况更紧凑。本文的研究结果表明,该模型描述了蛋白质的一些结构特性,并提出随机性是一个重要因素,但蛋白质受到狭窄的角度高斯概率分布的驱动,而非随机行走过程。

作者:P. H. Figueiredo, M. A. Moret, E. Nogueira Jr. and S. Coutinho

论文ID:0711.3876

分类:Biological Physics

分类简称:physics.bio-ph

提交时间:2009-11-13

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