复杂大分子中的扭结孤子：从DNA到聚乙烯
摘要：DNA扭转动力学在转录过程中是必不可少的；几位作者提出了关于它的简单模型，尤其是Yakushevich（Y模型）。 这些模型与DNA分离动力学的模型密切相关，首先由Peyrard和Bishop提出，而后由Dauxois、Barbi、Cocco和Monasson等人发展而来，但支持拓扑孤立子。 我们最近发展了一个“复合”版本的Y模型，在该模型中，磷酸糖基团和碱基由分开的自由度描述。 与简单的Y模型相比，它可以更好地拟合实验数据，并显示出超出DNA动力学范畴有趣的动力学现象。 特别重要的是通过调节非线性介质的物理参数来选择孤立子的速度的机制，以及将相关自由度进行“主”和“从”式的分层隔离。 这些机制不仅适用于DNA，也适用于更一般的大分子，我们通过考虑聚乙烯的情况来具体展示。
作者：Mariano Cadoni, Roberto De Leo, Sergio Demelio and Giuseppe Gaeta
论文ID：0710.4475
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2009-11-13