使用Rappertk进行RNA采样和晶体学精修
摘要：使用离散约束为基础的构象采样技术，在该研究中，我们利用Richardson RNA主链rotamer库和无偏的三糖特定二面角分布，实现对RNA链、末端和环的全原子采样。通过在不同空间约束下对多样性的RNA链进行基准测试，我们评估了Rappertk的采样行为。我们开发了一个迭代复合晶体学细化协议，并展示了它在tRNA（Asp）结构的部分上优于仅CNS细化的结果，这为进一步研究RNA建模和晶体学提供了激动人心的可能性。
作者：Swanand Gore and Tom Blundell
论文ID：0710.3948
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2007-10-23