使用环境特异替代表格鉴定酶中的特异性决定残基

摘要:使用环境特异性替代表来有效地区分蛋白质的结构和功能约束,从而确定其活性位点(Chelliah et al. (2004))。本研究探讨是否可以使用类似的方法来确定决定辅因子依赖性、底物特异性或微妙的催化变化的特异性决定残基(SDR)。我们将结构-序列信息和各种数据来源的功能注释相结合,为同源酶创建结构比对和功能分区。我们开发了一个评分程序来预测SDR,并使用与结合的特定配体和已发表的文献的信息来评估其准确性。

作者:Swanand Gore and Tom Blundell

论文ID:0710.2808

分类:Quantitative Methods

分类简称:q-bio.QM

提交时间:2007-10-16

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