在剪切流中的蛋白质
摘要：使用布朗动力学模拟研究剪切流中单个蛋白质分子的构象动力学。使用基于结构的粗粒化模型对蛋白质进行建模。我们考虑了泛素和整合素两种蛋白质，并发现在适度的剪切速率下，它们通过一系列亚稳态状态展开 - 这种模式与同聚合物中的平滑展开不同。仅在非常大的剪切速率下才会发生完全展开。此外，氨基酸之间的流体动力学相互作用被证明会阻碍剪切流中的展开过程。展开过程的特征取决于蛋白质是否锚定，如果是，则取决于锚点的选择。
作者：P. Szymczak and Marek Cieplak
论文ID：0710.2235
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2009-11-13