基于内部计算的化学遗传学的核方法

摘要:预测小分子与蛋白质之间的相互作用是药物发现过程的关键因素。特别是,精确的预测模型越来越多地被用于从大型分子数据库中预先选择潜在的引领化合物,或者用于筛查副作用。虽然经典的in silico方法侧重于预测与给定特定靶点的相互作用,但新的化学基因组学方法采用了跨靶点的视角。基于生物和化学信息学中核方法的最新研究进展,我们提出了一个系统的框架,用于筛查小分子的化学空间与蛋白质的生物空间之间的相互作用。我们展示了这个框架允许在不同目标之间共享信息,从而显著提高了对三个重要药物靶点的配体预测准确性:酶、GPCR和离子通道。

作者:Laurent Jacob (CB), Jean-Philippe Vert (CB)

论文ID:0709.3931

分类:Quantitative Methods

分类简称:q-bio.QM

提交时间:2007-09-26

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