核苷酸序列中检测重组的双阶段方法
摘要:重组是一种在同源基因组中产生异质性的系统进化史的过程。单一重组检测方法可能无法准确检测到重组事件,因此,我们引入一种两阶段策略,结合三个统计测量方法来检测重组事件的发生,并应用贝叶斯系统进化方法确定核苷酸序列中重组事件的断点。我们通过模拟数据评估了这些方法的性能,并展示了这种策略对实际数据的适用性。该两阶段策略在处理大数据集时具有时间效率,并能产生高可信度的结果。
作者:Cheong Xin Chan, Robert G. Beiko and Mark A. Ragan
论文ID:0709.1874
分类:Populations and Evolution
分类简称:q-bio.PE
提交时间:2007-09-13