电泳酶对核苷酸和重复序列的连续添加模型
摘要：描述目标酶的核苷酸和重复加入过程的模型。在该模型中，持续核苷酸添加是基于两个要求实现的：一个是干细胞IV环刺激核苷酸合并的化学反应，另一个是与聚合酶位点相邻的ssRNA结合位点的存在，该位点对模板的不成对碱基具有高亲和力。在与模板上的最后一个碱基成对的核苷酸结合后，DNA：RNA杂交体的解缔是重复添加过程性的前提，这是由引发引物波动的干细胞III伪结所导致的。该力来自于干细胞IV环朝着核苷酸结合的聚合酶位点摆动而引起的干细胞III伪结的展开。基于该模型，定量研究了Tetrahymena端粒酶的持续核苷酸和重复添加的动力学，这对先前的实验结果提供了很好的解释。此外，提出了一些预测。特别是，预测重复添加过程性主要由解离DNA：RNA杂交体所需自由能和展开干细胞III伪结所需自由能之间的差异决定，差异越大，重复加入过程性越低，差异越小，重复加入过程性越高。
作者：Ping Xie
论文ID：0708.2527
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2007-08-21