基因组:处于混沌边缘的最大信息容量
摘要:基因组序列的边缘混沌生活的顺序指数phi的提出 摘要: 我们提出了一个顺序指数phi,用于量化应用于基因组序列时的"边缘混沌生活"的概念。它将基因组映射为从0(随机且无限长)到1(完全有序)的数字,并且无论序列长度如何都适用。在GenBank中的786个完整基因组序列的phi值发现处于一个非常狭窄的范围内,为0.037+/-0.027。我们展示这意味着基因组在完全随机的一半位置,也就是处于边缘混沌的状态。我们认为这个狭窄的范围代表了序列空间中的一个固定点的邻域,基因组由一个强大的、主要中性的进化过程的动力学推动进入此范围。
作者:Sing-Guan Kong, Hong-Da Chen, Wen-Lang Fan, Jan Wigger, Andrew Torda, and HC Lee
论文ID:0708.1598
分类:Genomics
分类简称:q-bio.GN
提交时间:2007-08-14