螺旋酶转位和核酸解旋的双态模型
摘要：双螺旋解旋酶是能够解开双链核酸（如DNA和RNA）的分子驱动器。通常，解旋酶在解旋过程中沿着核酸的一个单链移动，并利用三磷酸腺苷（ATP）水解作为能源。在本研究中，我们建立了一个解旋酶机制的模型，该模型可以在两种状态之间切换，这可以代表ATP水解周期中的两个不同点。我们的模型是对早期由Betterton-J"ulicher建立的解旋酶模型的扩展，以纳入两种状态之间的切换。该模型的主要预测是双链核酸解旋的速度以及平均解旋速度周围的波动。由于最近有报道称丙型肝炎病毒的NS3解旋酶遵循闪烁槽轮机制，我们将NS3解旋酶的实验结果与我们模型的一个特殊极限进行比较，该极限对应于闪烁槽轮场景。我们的模型解释了NS3解旋酶实验数据的一个关键特征。然而，在不同条件下进行的实验中存在矛盾的观察结果，限制了将模型与实验进行比较的能力。
作者：Ashok Garai, Debashish Chowdhury and M. D. Betterton
论文ID：0707.2766
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2008-06-15