从多态频谱中检测定向选择
摘要：种群中遗传多态性的分布包含有关位点上突变率和自然选择强度的信息。在这里，我们展示了泊松随机场（PRF）方法在种群遗传推断中存在一些系统偏差，这些偏差倾向于低估选择压力和突变率，并错误地推断为正选择。这些问题源于PRF方法中固有的无限位点近似。我们引入了三种新的推断技术来纠正这些问题。我们提出了PRF方法的有限位点修改，以及基于扩散模型的推断选择压力和突变率的两种新方法。我们的方法不仅可以推断基因序列上的选择压力的“加权平均”，还可以推断不同位点上选择压力的分布。我们通过与Wright-Fisher模拟的比较来评估我们方法以及原始PRF方法的准确性。
作者：Michael M Desai, Joshua B. Plotkin
论文ID：0707.2428
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2007-07-18