密码子使用偏向性的熵方法测量
摘要:密码使用偏差度量是通过计算真实密码频率分布与准平衡密码频率分布的互信息计算来定义的。后者有三种定义方式:(1)同义密码的频率被假定为相等(即其频率的算术平均值);(2)它与三联体的频率分布相一致;最后,(3)准平衡频率分布被定义为从二核苷酸频率分布导出的密码的期望频率。密码使用偏差度量是针对125个细菌基因组计算的。
作者:Michael G.Sadovsky, Julia A.Putintzeva
论文ID:0706.2077
分类:Genomics
分类简称:q-bio.GN
提交时间:2007-06-15