蛋白质结构预测的迭代搜索方法

摘要:新算法:差分映射法在寻找最小化非键能量函数的蛋白质构象方面展示了新的方法。差分映射法同时寻找满足两个约束空间的原子配置,第一个约束空间是具有有效多肽几何结构的原子配置空间,而第二个约束空间是具有低于给定目标的非键能量的配置空间。利用这两个约束空间定义了一个确定性动力系统,其固定点在两个约束空间的交集中产生原子配置。差分映射法产生低能量蛋白质构象的速率与当代搜索算法并行淬火进行了比较。结果显示,差分映射法较并行淬火能够以更高的速率找到低能量的蛋白质构象。

作者:Ivan C. Rankenburg, Veit Elser

论文ID:0706.1754

分类:Biomolecules

分类简称:q-bio.BM

提交时间:2007-06-13

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