互为最佳匹配并不是同源性的逻辑充分条件

摘要:互相最佳命中在确定序列之间的同源性时是常见的,也被称为回飞标准。最佳命中可能通过blast或其他最近开发的算法找到。先前的研究似乎已经假设互相最佳命中是同源性的充分条件但不是必要条件。在本文中,我解释了为什么互相最佳命中在逻辑上不能成为同源性的充分条件。如果互相最佳命中对于同源性既不充分也不必要,那么进一步研究用于识别同源物的一些无监督算法的逻辑基础似乎是值得的。

作者:Toby Johnson

论文ID:0706.0117

分类:Genomics

分类简称:q-bio.GN

提交时间:2007-06-04

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