基于逼真的晶格模型的Kinesin自由能势景
摘要：运用具有Go相互作用的晶格蛋白模型来研究kinesin马达蛋白域在热平衡中的结构波动。通过多重自相重叠集合（MSOE）蒙特卡洛方法和主成分分析（PCA），获得了自由能地形。结果表明，kinesin具有两个亚域，在功能上重要的区域存在部分折叠/展开：一个位于核苷酸结合位点周围，另一个包括主要的微管结合位点。这些亚域与最近基于实验结构得出的结构变异相一致。另一方面，B因子或正态模式分析并未捕获到如此大的结构波动。因此，它们超出了弹性范围，必须考虑链的连接性来研究kinesin的功能。
作者：Hiroo Kenzaki, Macoto Kikuchi
论文ID：0706.0076
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2007-06-04