混合树：系统发育混合的结构
摘要：应用新的几何和组合方法来研究系统发育混合问题。几何方法的重点是描述两态随机集群模型中系统发育混合分布的几何特征，该模型是两态对称(CFN)模型的推广。特别地，我们显示混合分布的集合形成一个凸多面体，并计算其维数；推论包括对于混合的分支长度在星形树上可以模拟一个明示四联树的位点模式频率向量的一个简单判别条件。此外，通过计算多面体的体积，我们可以澄清在CFN模型下“共同”的非可区分的混合有多普遍。我们还提出了一个新的组合结果，将尺寸为六的特定树对的任意可区分结果推广到任意树对。接下来我们提出一个正面的结果展示基于位点的速率模型的可区分性。最后，我们回答了先前论文中关于CFN模型下大于四联树的树上“混合分支排斥”问题所提出的问题。
作者：Frederick A. Matsen, Elchanan Mossel and Mike Steel
论文ID：0705.4328
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2007-11-08