染色质在人类基因组功能中的折叠
摘要：染色质的三维结构与基因组功能密切相关，特别是转录。然而，在间期细胞核中，染色质纤维的折叠路径是未知的。本研究系统地测量了人体原代成纤维细胞G1核中染色体1和11上基因密集区域和基因稀疏活动较少区域中成对标记的基因组位置的三维物理距离，使用荧光原位杂交。基于聚合物物理学，我们解释了我们的结果和其他人发表的结果，表明染色质纤维的折叠可以描述为处于球状状态的聚合物（GS），通过抵消自我避免力的聚合物内吸引相互作用维持。GS聚合物模型能够描述高表达区域和低表达区域中的染色质折叠，表明它们在库恩长度和染色质紧密度上存在差异。每种基因组区域都构成了相对紧凑的球状折叠态的集合体，导致了在其他方面相同的细胞之间存在相当大的细胞间变异。我们提出了染色质纤维在间期折叠的不同聚合物折叠机制的证据，在数百万碱基对尺度和整个染色体臂（数十兆碱基对）尺度上都存在。我们的结果提出了间期染色质纤维折叠的新视角，并开启了探索染色质纤维内部相互作用性质的可能性。
作者：Julio Mateos-Langerak, Osdilly Giromus, Wim de Leeuw, Manfred Bohn, Pernette J. Verschure, Gregor Kreth, Dieter W. Heermann, Roel van Driel and Sandra Goetze
论文ID：0705.1656
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2007-05-23