单一树上的系统发育混合可以模拟另一拓扑结构的树
摘要：混合模型描述了常见的分子进化不均匀现象。当底层数据由混合模型生成时，系统发育重建方法的性能引发了一系列的争议。争议主要源于在给定树拓扑结构上模拟混合模型数据，使得重建算法输出了不同拓扑结构的树；这些发现被用来展示特定树重建方法的不足之处。因此，基于足够多的数据和“正确”的方法，假设可以从一种拓扑结构上的混合模型数据中区分出另一种未混合拓扑结构上的数据。在这里，我们展示了这个假设是错误的。对于生物学家来说，我们的结果意味着，例如，两个基因的结合数据，其系统发育树仅在分支长度方面不同，可以完全适应于不同拓扑结构的树。
作者：Frederick A. Matsen and Mike Steel
论文ID：0704.2260
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2007-06-30