大分子构象转变的最优灵活性
摘要:高度灵活的杠杆式结构在大分子复合物中的构象转变中经常涉及重新定位。通过使用一个简单的理论模型,我们表明,如果杠杆可以弯曲,例如在局部“铰链”处,这种转变的速率将大大提高。令人惊讶的是,在铰链的中间灵活性程度时,转变速率最快。在这个中间区域中,转变速率对于连接到杠杆臂的“货物”数量也最不敏感,这可以被分子马达所利用。为了解释这一效应,我们将Kramers-Langer理论推广到了依赖于构型的流动性矩阵的多维障碍穿越情况。
作者:Richard A. Neher, Wolfram Mobius, Erwin Frey, Ulrich Gerland
论文ID:0704.1546
分类:Biomolecules
分类简称:q-bio.BM
提交时间:2009-11-13